林士弘派他的弟弟鄱阳王林药师攻打循州，刺史杨略与他交战，斩杀林药师，林士弘的将领王戎献出南昌州投降。林士弘感到害怕，己巳日，请求投降。不久又逃到安成山洞坚守，袁州百姓聚集起来响应他；洪州总管若干则派兵击败了他们。恰逢林士弘去世，他的部众于是溃散。
淮阳王李道玄战败后，山东地区震动惊骇，洺州总管庐江王李瑗弃城向西逃走，各州县都反叛归附刘黑闼，十天之内，刘黑闼完全收复了原来的地盘，乙亥日，进军占据洺州。十一月庚辰日，沧州刺史程大买被刘黑闼逼迫，弃城逃走。齐王李元吉畏惧刘黑闼兵力强盛，不敢进军。
唐高祖在晋阳起兵，都是秦王李世民的谋划，高祖对李世民说：“如果大事成功，天下都是你带来的，应当立你为太子。”李世民跪拜推辞。等到高祖成为唐王，将领僚属也请求立李世民为世子，高祖准备立他，李世民坚决推辞才作罢。太子李建成，性情宽厚简约，喜好酒色打猎；齐王李元吉，有很多过失；两人都不受高祖宠爱。李世民的功劳名声日益显赫，高祖常常有意让他取代李建成，李建成内心不安，于是与李元吉合谋，共同排挤李世民，各自拉拢亲信，培植党羽。
高祖晚年宠爱很多妃嫔，有近二十位小王子，他们的母亲争相结交各位年长的王子来巩固自己的地位。李建成和李元吉刻意讨好各位妃嫔，谄媚奉承、贿赂馈赠，无所不为，以此求得高祖的宠爱。有人说他们与张婕妤、尹德妃有不正当关系，宫廷内部隐秘，无人能查明真相。当时，东宫、各位王公、公主的府邸以及后宫亲戚在长安城中横行霸道，肆意做违法之事，官吏不敢追究。李世民居住在承乾殿，李元吉居住在武德殿后院，与皇帝寝宫、东宫昼夜通行，没有任何限制。太子、两位亲王出入皇帝寝宫，都骑马携带弓箭刀器等杂物，相遇时如同家人一般行礼。太子的命令、秦王和齐王的教令与皇帝的诏书并行，官吏不知道该听从谁的，只能根据收到的先后顺序来决定。只有李世民不讨好各位妃嫔，各位妃嫔争相称赞李建成、李元吉，而诋毁李世民。
李世民平定洛阳后，高祖派贵妃等几人前往洛阳挑选隋朝宫女，没收府库珍宝。贵妃等人私下向李世民索要珍宝财物，并为自己的亲属求官，李世民说：“珍宝财物都已登记上奏，官职应当授予贤能有功的人。”一律没有答应，因此妃嫔们更加怨恨他。李世民因为淮安王李神通有功，赏赐给他几十顷田地。张婕妤的父亲通过张婕妤向高祖请求得到这些田地，高祖亲手写下诏书赏赐给他，李神通因为李世民的教令在先，不交出田地。张婕妤向高祖告状说：“陛下赏赐给我父亲的田地，被秦王夺走给了李神通。”高祖于是发怒，斥责李世民说：“我的手诏不如你的教令吗！”有一天，高祖对左仆射裴寂说：“这个儿子长期在外掌管军队，被书生教唆，不再是以前的那个儿子了。”尹德妃的父亲阿鼠骄横跋扈，秦王府属官杜如晦经过他的家门，阿鼠的家童几人把杜如晦拽下马，殴打他，打断了一根手指，说：“你是什么人，敢经过我家门口不下马！”阿鼠担心李世民向高祖告状，先让尹德妃上奏说：“秦王的手下欺凌我的家人。”高祖又发怒斥责李世民说：“我妃嫔的家人尚且被你的手下欺凌，更何况普通百姓呢！”李世民详细辩解，高祖始终不相信。
李世民每次在宫中侍奉宴会，面对各位妃嫔，想起太穆皇后早逝，没能看到高祖拥有天下，有时会叹息流泪，高祖看了很不高兴。各位妃嫔趁机暗中一起诋毁李世民说：“天下幸好无事，陛下年纪大了，只应该安心享乐，而秦王常常独自流泪，这是憎恨我们。陛下万岁之后，我们母子必定不会被秦王容纳，会被杀得一个不留！”于是一起哭泣，并且说：“皇太子仁爱孝顺，陛下把我们母子托付给他，一定能保全我们。”高祖对此感到悲伤。从此不再有更换太子的想法，对待李世民渐渐疏远，而与李建成、李元吉日益亲近。
太子中允王珪、洗马魏征劝说太子李建成：“秦王功劳盖过天下，朝廷内外都归心于他；殿下只是因为年长位居东宫，没有大功来镇服天下。如今刘黑闼是溃散后的残余势力，部众不足一万，物资粮草匮乏，用大军进攻，势必如同摧枯拉朽，殿下应当亲自率军攻打他来获取功名，趁机结交山东的豪杰，或许可以巩固自己的地位。”李建成于是向高祖请求出征，高祖答应了他。王珪是王頍的侄子。甲申日，朝廷下诏命太子李建成领兵讨伐刘黑闼，陕东道大行台及山东道行军元帅、河南、河北各州都受李建成调度，允许他随机行事。
乙酉日，朝廷封宗室略阳王李道宗等十八人为郡王。李道宗是李道玄的堂弟，担任灵州总管时，梁师都派弟弟梁洛儿率领几万突厥军队包围他，李道宗趁机出击，大败敌军。突厥与梁师都勾结，派郁射设进入原来的五原地区居住，李道宗将他驱逐，开拓疆土一千多里。高祖认为李道宗的军事才能如同曹魏的任城王曹彰，于是立他为任城郡王。
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丙申日，高祖前往宜州。
己亥日，齐王李元吉派兵在魏州攻打刘十善，击败敌军。
癸卯日，高祖在富平打猎。
刘黑闼率领军队向南进军，自相州以北的州县都归附他，只有魏州总管田留安领兵坚守。刘黑闼攻打魏州，没能攻克，领兵向南攻克元城，又返回攻打魏州。
十二月庚戌日，朝廷封宗室李孝友等八人为郡王。李孝友是李神通的儿子。
丙辰日，高祖在华池打猎。
戊午日，刘黑闼攻陷恒州，杀死刺史王公政。
庚申日，高祖返回长安。
癸亥日，幽州大总管李艺收复廉州、定州。
甲子日，田留安攻打刘黑闼，击败敌军，俘获刘黑闼的莘州刺史孟柱，降服六千名将领士兵。当时，山东的豪杰大多杀死官吏响应刘黑闼，上下互相猜疑，人心更加离散怨恨；只有田留安对待官吏百姓坦然无疑，报告事情的人无论亲疏，都允许直接进入他的卧室，他常常对官吏百姓说：“我和你们一起为国家抵御贼寇，本来就应该同心协力，如果有人一定要弃顺从逆，只管砍下我的头颅离开。”官吏百姓都相互告诫说：“田公以赤诚待人，我们应当拼死效力报答他，绝对不能辜负他。”有个叫苑竹林的人，本来是刘黑闼的党羽，暗中怀有异心。田留安知道后，没有揭发他，反而把他安排在身边，托付他掌管钥匙；苑竹林深受感动，于是真心归顺，最终发挥了作用。田留安因功被进封为道国公。
乙丑日，并州刺史成仁重攻打范愿，击败敌军。
刘黑闼攻打魏州未能攻克，太子李建成、齐王李元吉的大军抵达昌乐，刘黑闼领兵抵御，两次布阵，都未交战就撤兵了。魏征对太子说：“之前打败刘黑闼时，他的将帅都被点名处死，妻儿被俘虏；所以齐王前来时，即便有诏书赦免其党羽的罪责，众人也都不信。如今应当全部释放被俘人员，安抚慰问后遣送回去，这样就能坐看他的部众离散了！”太子听从了他的建议。刘黑闼军中粮草耗尽，很多人逃亡，有人还捆绑着首领前来投降。刘黑闼担心魏州城内的士兵出城，与唐军里外夹击，于是连夜逃跑。到达馆陶时，永济桥还没建成，无法渡河。壬申日，太子、齐王率领大军赶到，刘黑闼让王小胡背水布阵，自己监督桥梁修建，桥一建成就率军过河向西逃去，部众于是大败，丢弃兵器前来投降。唐军过桥追击刘黑闼，刚过去一千多骑兵，桥就塌了，刘黑闼因此得以率领几百名骑兵逃走。
唐高祖因隋末很多战士战死在高丽，这一年，写信给高丽王高建武，让他把战死战士的遗体全部送回；也让各州县长官搜寻在中原的高丽人，遣送他们回国。高建武遵奉诏书，前后遣返中原百姓数以万计。
武德六年癸未，公元623年
春季正月己卯日，刘黑闼任命的饶州刺史诸葛德威捉住刘黑闼，献城投降。当时太子派骑将刘弘基追击刘黑闼，刘黑闼被官军追击，奔走不停，到达饶阳时，随从仅剩一百多人，极度饥饿。诸葛德威出城迎接，邀请刘黑闼进城，刘黑闼不肯；诸葛德威流泪坚决请求，刘黑闼才答应。到城边集市中休息时，诸葛德威送来食物；还没吃完，诸葛德威就领兵捉住刘黑闼，押送给太子，刘黑闼和他的弟弟刘十善在洺州被斩首。刘黑闼临刑前叹息说：“我真该在家种庄稼，却被高雅贤的罪过连累到这般地步！”
壬午日，巂州人王摩沙起兵，自称元帅，改年号为进通；朝廷派遣骠骑将军卫彦讨伐他。
庚子日，任命吴王杜伏威为太保。
二月庚戌日，唐高祖前往骊山温泉；甲寅日，返回宫中。
平阳昭公主去世。戊午日，安葬公主。朝廷下诏为她配备前后部鼓吹乐、四十名持班剑的卫士，以及武贲甲士。太常寺上奏说：“按礼仪，妇人不能用鼓吹乐。”高祖说：“鼓吹是军乐。公主亲自执掌金鼓，发动义兵辅佐完成大业，怎能和普通妇人相比！”
丙寅日，徐圆朗走投无路，与几名骑兵弃城逃跑，被乡野百姓杀死，他占据的地区全部平定。
林邑王梵志派使者入朝进贡。起初，隋朝打败林邑，将其领土分为三郡。等到中原战乱，林邑复国，至此才开始入朝进贡。
幽州总管李艺请求入朝；庚午日，任命李艺为左翊卫大将军。
废除参旗等十二军。
三月癸未日，高开道抢掠文安、鲁城，骠骑将军平善政截击，击败了他。
庚子日，梁师都的将领贺遂、索同率领所辖十二州前来投降。
乙巳日，前洪州总管张善安反叛，朝廷派遣舒州总管张镇周等人讨伐他。
夏季四月，吐谷浑侵犯芳州，刺史房当树逃奔松州。
张善安攻陷孙州，捉住总管王戎后离去。乙丑日，鄜州道行军总管段德操攻打梁师都，抵达夏州，俘获当地百姓和牲畜后返回。
丙寅日，吐谷浑侵犯洮州、岷州。
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丁卯日，南州刺史庞孝恭、南越州百姓宁道明、高州首领冯暄一同反叛，攻陷南越州，进攻姜州；合州刺史宁纯领兵救援。
壬申日，立皇子李元轨为蜀王、李元凤为豳王、李元庆为汉王。
癸酉日，任命裴寂为左仆射，萧瑀为右仆射，杨恭仁为吏部尚书兼中书令，封德彝为中书令。
五月庚辰日，派遣岐州刺史柴绍救援岷州。
庚寅日，吐谷浑及党项侵犯河州，刺史卢士良击败了他们。
丙申日，梁师都的将领辛獠儿带领突厥侵犯林州。
戊戌日，苑君璋的将领高满政侵犯代州，骠骑将军李宝言击退了他。
癸卯日，高开道带领奚族骑兵侵犯幽州，长史王诜击败了他。刘黑闼反叛时，突地稽领兵援助唐朝，朝廷将他的部落迁徙到幽州的昌平城；高开道带领突厥侵犯幽州，突地稽领兵截击，打败了敌军。
六月戊午日，高满政献出马邑前来投降。此前，前并州总管刘世让被任命为广州总管，即将赴任，高祖询问他守边的策略，刘世让回答说：“突厥近来多次入侵，实在是因为马邑是他们的中途补给站。请派勇将驻守崞城，多储备金银布帛，招募投降的人给予厚赏，频繁派出骑兵抢掠马邑城下，践踏他们的庄稼，破坏他们的生计，不出一年多，他们没有粮食，必定会投降。”高祖赞同他的计策，说：“除了你，谁能担任这个勇将！”当即命令刘世让驻守崞城，马邑因此深受困扰。当时，马邑人大多不愿归属突厥，高祖又派人招抚苑君璋。高满政劝说苑君璋杀死全部突厥守兵投降唐朝，苑君璋不听。高满政顺应众人意愿，连夜袭击苑君璋，苑君璋察觉后，逃奔突厥，高满政杀死苑君璋的儿子及二百名突厥守兵后投降。
壬戌日，梁师都带领突厥侵犯匡州。
丁卯日，苑君璋与突厥吐屯设侵犯马邑，高满政与他们交战，击败了敌军。朝廷任命高满政为朔州总管，封荣国公。
瓜州总管贺若怀广巡视到沙州时，恰逢沙州人张护、李通反叛，贺若怀广率领几百人坚守子城；凉州总管杨恭仁派兵救援，被张护等人击败。
癸酉日，柴绍与吐谷浑交战，被吐谷浑包围，敌军占据高处射箭，箭矢如雨。柴绍派人弹奏胡琵琶，让两名女子相对跳舞。敌军感到奇怪，放下弓箭一起观看，柴绍察觉敌军没有防备，暗中派遣精锐骑兵从敌军阵后出击，敌军大败。
秋季七月丙子日，苑君璋带领突厥侵犯马邑，右武候大将军李高迁及高满政抵御，在腊河谷交战，击败敌军。张护、李通杀死贺若怀广，拥立汝州别驾窦伏明为主，进逼瓜州；长史赵孝伦击退了他们。
高开道抢掠赤岸镇及灵寿、九门、行唐三县后离去。
丁丑日，岗州刺史冯士翙占据新会反叛，广州总管刘感讨伐并降服了他，让他恢复原职。
辛巳日，高开道所辖的弘阳、统汉二镇前来投降。
癸未日，突厥侵犯原州；乙酉日，侵犯朔州。李高迁被敌军击败，行军总管尉迟敬德领兵救援。己亥日，派遣太子领兵驻守北方边境，秦王李世民驻守并州，防备突厥。八月甲辰日，突厥侵犯真州，又侵犯马邑。
壬子日，淮南道行台仆射辅公祏反叛。起初，杜伏威与辅公祏关系友好，辅公祏年长，杜伏威把他当作兄长对待，军中称他为伯父，对他的敬畏与对杜伏威相同。杜伏威渐渐猜忌他，于是任命自己的养子阚棱为左将军，王雄诞为右将军，暗中夺取辅公祏的兵权。辅公祏得知后，心中不满，与他的老朋友左游仙假装学道辟谷，以此隐晦自己的意图。等到杜伏威入朝，留下辅公祏守卫丹杨，命令王雄诞掌管军队辅佐他，暗中对王雄诞说：“我到长安后，若能保住官职，就不让辅公祏发动变乱。”杜伏威出发后，左游仙劝说辅公祏谋反；但王雄诞掌握兵权，辅公祏无法动手。于是他谎称收到杜伏威的书信，怀疑王雄诞有二心，王雄诞听说后很不高兴，称病不再处理事务；辅公祏趁机夺取他的兵权，派自己的党羽西门君仪向他说明谋反的计划。王雄诞这才醒悟后悔，说：“如今天下刚刚平定，吴王又在京师，大唐军威所向无敌，为何要无故自取灭族之祸！我王雄诞唯有一死，不敢听从命令。如今跟随你反叛，不过多活一百天罢了，大丈夫怎能贪恋片刻的性命，而让自己陷入不义之地呢！”辅公祏知道无法让他屈服，将他缢杀。王雄诞善于安抚士兵，士兵都愿意为他拼死效力，而且他治军严明，每次攻克城池，都秋毫无犯。他去世那天，江南军中及民间百姓都为他流泪。辅公祏又谎称杜伏威无法返回江南，送来书信命令他起兵，大规模修造铠甲兵器，运输粮草储备。不久在丹杨称帝，国号宋，修复陈朝的旧宫殿居住。设置百官，任命左游仙为兵部尚书、东南道大使、越州总管，与张善安联合兵力，任命张善安为西南道大行台。
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